Lehre & Beispielkurs:
Paraview for Biological Data

Ich biete maßgeschneiderte Kurse und Workshops zu Datenanalyse, Visualisierung, Python und wissenschaftlichem Rechnen an. Nachfolgend finden Sie Kurse, die ich gehalten habe, sowie ein Beispielprogramm.

Derzeit biete ich Kurse im Rahmen meiner Haupttätigkeit an. Sie können mich dort kontaktieren: Kontakt aufnehmen.

Vergangene Kurse und Workshops

Paraview für biologische Daten

Paraview ist eine leistungsfähige 3D-Visualisierungsanwendung auf Basis von VTK. In diesem Kurs werden die Grundlagen wissenschaftlicher Visualisierung sowie praktische Techniken vermittelt, um aussagekräftige Visualisierungen für Pflanzen-/Bodendaten und Geodaten zu erstellen.

Format: Online — vier Sessions (morgens/nachmittags). Materialien: Hedgedoc mit kollaborativen Notizen; der Videokonferenzlink wird Teilnehmer*innen bereitgestellt.

Veranstaltungsseite

Vorsichtige Einführung
Installation von Paraview, Benutzeroberfläche und Viewport-Steuerung. Paraview hat viele Funktionen, mit denen man sich anfreunden muss.
Themen: Nutzeroberfläche, Installation, Viewport-Navigation

Navigation des Viewports
Überblick über die Funktionen zur 3D Navigation und Datenansicht, einschließlich Kamerasteuerung, Auswahlwerkzeuge und Pipeline-Browser.
Themen: Interface-Übersicht, Pipeline-Browser, Auswahl, Kamerasteuerung

Farben & Lookup-Tabellen
Grundlegende Farbtheorie für wissenschaftliche Visualisierung und praktische Verwendung von Lookup-Tabellen zur Abbildung von Daten auf Farbe und Transparenz.
Themen: Farbskalen, divergierende vs sequentielle Skalen, Opazitätszuordnung, wahrnehmungsbasierte Auswahl

Datenimport & -verarbeitung
Verständnis unterschiedlicher Datenmodalitäten, Punkt- vs Zellen-Daten, Koordinaten und korrektes Importieren gängiger wissenschaftlicher Dateiformate.
Themen: VTP, Volumendateien, Geodatenformate, RAW, Punkt-/Zellenattribute

Arbeiten mit Filtern
Wesentliche Filteroperationen und Kombination von Filtern zum Reinigen, Extrahieren und Transformieren von Daten für Visualisierungen.
Themen: Threshold, Clip, Slice, Calculator, Resample

Mehrere Datentypen & Geometrien
Strategien zum Kombinieren und Visualisieren mehrerer Datensätze und Geometrietypen (Strukturen, Geometrien, Volumina) in einer Szene.
Themen: Quellen zusammenführen, Transformationen, Geometriehandling, zusammengesetzte Datensätze

Pflanzen- / Boden-Visualisierung
Praktische Demonstration zur Visualisierung von Pflanzen- und Bodendaten, inklusive Kombination unterschiedlicher Modalitäten wie Wurzeldaten und 3D-Bodendomänen.
Themen: Pflanzen-/Bodendaten, 3D-Darstellung, multimodale Visualisierung

Geodaten
Demonstration zum Umgang mit Geodaten in Paraview: Laden gängiger GIS-Formate, Umgang mit Koordinatenreferenzsystemen und explorative Darstellungs- techniken.
Themen: GIS-Formate, CRS, räumliche Datenvisualisierung

Bonus
Paraview Python (Bonus)
Kurze Einführung in Paraview-Python-Scripting, benutzerdefinierte Presets und Best Practices für reproduzierbare Visualisierungen und den Export von Abbildungen.
Themen: Paraview-Python-Scripting, reproduzierbare State-Dateien, hochwertige Exporte

Bonus
Plugins & Erweiterungen (Bonus)
Überblick über nützliche Paraview-Plugins und Erweiterungen zur Erweiterung der Funktionalität, inkl. Installation und Anwendungshinweisen (z.B. Node Editor, TTK).
Themen: Nützliche Plugins, Installation, Node Editor, TTK